中文Naujasis Pietų Afrikos koronaviruso variantas 501Y-V2
2020 m. gruodžio 18 d. Pietų Afrika aptiko naujojo koronaviruso mutantą 501Y-V2.Dabar Pietų Afrikos mutantas išplito į daugiau nei 20 šalių.Eksperimentai parodė, kad virš naujojo koronaviruso mutantai gali turėti kitų naujojo koronaviruso K417N/T, E484K ir N501Y mutacijų variantų, kurie gali sumažinti vakcinos sukeltų plazmą neutralizuojančių antikūnų neutralizuojantį gebėjimą.Tačiau, palyginti su etaloniniu genomu Wuh01 (sekos numeris MN908947), Pietų Afrikos mutanto genomo sekos 501Y.V2 turi 23 nukleotidų variantus.Jis turi tą pačią N501Y mutaciją kaip ir Didžiosios Britanijos mutanto B.1.1.7 potipis, bet vis tiek turi mutacijų dviejose pagrindinėse S baltymo vietose E484K ir K417N, kurios gali turėti reikšmingą poveikį viruso gebėjimui užkrėsti.
Naujasis koronavirusas yra vienos grandinės RNR virusas, kurio genomo mutacijos yra dažnesnės.Vieno taikinio aptikimas gali lengvai lemti, kad mėginiai, kurių viruso kiekis yra mažas, ir mutavusių virusų padermių, gali būti neaptikti.Pakartotinio tyrimo dažnis vieno teigiamo tikslo aptikimo atveju gali siekti daugiau nei 10%, o tai gali padidinti darbo krūvį ir pailginti diagnostikos laiką.Kelių taikinių aptikimas ir abipusis kiekvieno taikinio rezultatų patikrinimas gali padidinti aptikimo dažnį ir palengvinti ankstyvą diagnostiką.
1 pav. Naujojo koronaviruso infekcijos mechanizmo schema
Didžiosios Britanijos naujasis koronaviruso mutantas B.1.1.7
2020 m. gruodžio 26 d. internete buvo paskelbtas pirmasis mokslinis straipsnis apie B.1.1.7 padermę.Londono Higienos universiteto JK ir atogrąžų ligų institutas patvirtino, kad B.1.1.7 padermė yra labiau pajėgi plisti nei kitos padermės, o tai buvo daugiau nei 56 % (95 % PI 50–74 %).Kadangi šios naujos mutantinės padermės perdavimo galia yra akivaizdesnė, suvaldyti COVID-19 tapo sunkiau.Kitą dieną Birmingamo universitetas Jungtinėje Karalystėje įkėlė straipsnį apie MedRxiv.Tyrimo metu nustatyta, kad pacientams, užsikrėtusiems B.1.1.7 mutantine paderme (S-geno iškritimas), žymiai padidėjo ORF1ab ir N viruso genų kopijų skaičius;Šis reiškinys buvo stebimas populiacijoje.Šiame straipsnyje nurodoma, kad pacientai, užsikrėtę Britanijos mutantu B.1.1.7, turi žymiai didesnį viruso kiekį, todėl šis mutantas taip pat gali būti patogeniškesnis.
2 pav. Genomo mutacijų seka, esanti Britanijos koronaviruso mutanto B.1.1.7 padermėje
3 pav. N501Y mutacija įvyko ir Didžiojoje Britanijoje, ir Pietų AfrikojeVariantai
Naujų koronaviruso variantų aptikimo rinkinys
Chuangkun Biotech Inc. sėkmingai sukūrė B.1.1.7 ir 501Y-V2 naujų koronaviruso variantų aptikimo rinkinį.
Šio gaminio privalumai: didelis jautrumas, vienu metu aptinkami 4 taikiniai, apimantys pagrindines B.1.1.7 mutanto padermės ir 501Y.V2 Pietų Afrikos mutanto padermės mutacijų vietas.Šis rinkinys vienu metu gali aptikti N501Y, HV69-70del, E484K mutacijų vietas ir naują koronaviruso S geną;Greitas testas: nuo mėginio paėmimo iki rezultato užtrunka tik 1 valandą 30 minučių.
4 pav. COVID-19 Britanijos varianto stiprinimo kreivės aptikimas
5 pav. COVID-19 Pietų Afrikos varianto stiprinimo kreivės aptikimas
6 pav. Laukinio tipo naujojo koronaviruso amplifikacijos kreivė
Neaišku, kaip šios mutacijos kaupia naują ilgalaikį pandemijos COVID-19 poveikį.Tačiau tai mums primena, kad šios mutacijos gali turėti įtakos natūralaus imuniteto veiksmingumui ir imunitetui, kurį sukelia vakcinacija.Tai taip pat primena, kad turime nuolat stebėti naująjį koronavirusą ilgą laiką ir atnaujinti COVID-19 vakciną, kad galėtume susidoroti su naujojo koronaviruso raida.
Paskelbimo laikas: 2021-03-12