„CHKBiotech“ sėkmingai sukūrė naujų koronaviruso variantų aptikimo rinkinį

Naujas Pietų Afrikos koronaviruso štamas 501Y-V2
2020 m. Gruodžio 18 d. Pietų Afrika aptiko naujo koronaviruso 501Y-V2 mutantą. Dabar Pietų Afrikos mutantas išplito daugiau nei 20 šalių. Eksperimentai parodė, kad aukščiau naujojo koronos viruso mutantai gali turėti kitų naujų koronaviruso K417N / T, E484K ir N501Y mutacijų variantų, kurie gali sumažinti vakcinos sukeltų plazmą neutralizuojančių antikūnų neutralizavimo gebėjimą. Tačiau, palyginti su etaloniniu genomu Wuh01 (eilės numeris MN908947), Pietų Afrikos mutantų genomo sekos 501Y.V2 turi 23 nukleotidų variantus. Ji turi tą pačią N501Y mutaciją kaip ir Britanijos mutantas B.1.1.7 potipis, tačiau vis dar yra mutacijų dviejose pagrindinėse S baltymo E484K ir K417N vietose, kurios gali turėti svarbų poveikį viruso gebėjimui užkrėsti.

Naujasis koronavirusas yra vienos grandies RNR virusas, kurio genomo mutacijos yra dažnesnės. Vieno taikinio aptikimas gali lengvai praleisti mėginius su mažu virusų kiekiu ir mutavusių virusų padermių aptikimu. Pakartotinio tyrimo dažnis nustatant tikslą gali siekti daugiau nei 10%, o tai gali padidinti darbo krūvį ir pailginti diagnozės nustatymo laiką. Daugelio taikinių aptikimas ir abipusis kiekvieno taikinio rezultatų patikrinimas gali padidinti aptikimo dažnį ir palengvinti ankstyvą diagnostiką.

news1

1 paveikslas. Naujo koronaviruso infekcijos mechanizmo schema

Naujasis Britanijos koronaviruso mutantas B.1.1.7
2020 m. Gruodžio 26 d. Internete buvo paskelbtas pirmasis B.1.1.7 padermės mokslinis darbas. Londono JK higienos ir tropinių ligų institutas patvirtino, kad B.1.1.7 padermė yra pajėgi plisti labiau nei kitos padermės, o tai buvo daugiau nei 56% (95% PI 50-74%). Kadangi ši nauja mutantinė padermė turi aiškesnę perdavimo galią, tapo sunkiau valdyti COVID-19. Kitą dieną Birmingemo universitetas, Jungtinė Karalystė, įkėlė straipsnį apie „MedRxiv“. Tyrimo metu nustatyta, kad ORF1ab ir N viruso genų kopijų skaičius pacientams, užsikrėtusiems B.1.1.7 mutantiniu štamu (S-geno iškritimas), buvo žymiai padidėjęs; šis reiškinys buvo stebimas populiacijoje. Šiame straipsnyje pabrėžiama, kad pacientams, užsikrėtusiems Didžiosios Britanijos B.1.1.7 mutantu, viruso apkrova yra žymiai didesnė, todėl šis mutantas taip pat gali būti patogeniškesnis.

1

2 paveikslas. Didžiosios Britanijos koronaviruso mutantų B.1.1.7 padermėje esanti genomo mutacijos seka

2

3 pav. N501Y mutacija įvyko tiek Didžiojoje Britanijoje, tiek Pietų Afrikoje Variantai

Naujų koronaviruso variantų aptikimo rinkinys
„Chuangkun Biotech Inc.“ sėkmingai sukūrė naujų koronaviruso variantų B.1.1.7 ir 501Y-V2 aptikimo rinkinį.

Šio produkto privalumai: didelis jautrumas - vienu metu aptinkami 4 taikiniai, apimantys pagrindines mutacinių B.1.1.7 ir 501Y.V2 mutantų padermių mutacijos vietas. Šis rinkinys gali vienu metu aptikti N501Y, HV69-70del, E484K mutacijos vietas ir naują koronaviruso S geną; Greitas testas: nuo mėginių paėmimo reikia tik 1 valandos 30 minučių.

3

4 paveikslas. COVID-19 Britain variantų amplitudės kreivės nustatymas

4

5 pav. COVID-19 Pietų Afrikos varianto amplifikacijos kreivės nustatymas

5

6 pav. Laukinio naujo koronaviruso amplifikacijos kreivės tipas

Neaišku, kaip šios mutacijos kaupia naują ilgalaikį pandemijos COVID-19 dešinės poveikį. Bet tai mums primena, kad šios mutacijos gali turėti įtakos natūralaus imuniteto ir imuniteto, kurį sukelia vakcinacija, veiksmingumui. Tai taip pat mums primena, kad turime nuolat stebėti naująjį koronavirusą ilgą laiką ir atnaujinti vakciną COVID-19, kad susidorotume su naujo koronaviruso raida.


Skelbimo laikas: 20-12-2021